Console Output

The recommended git tool is: NONE
No credentials specified
Fetching changes from the remote Git repository
Checking out Revision 06eaa16a203dcfe3e22546549d40185a79f25ac7 (refs/remotes/origin/master)
 > git rev-parse --resolve-git-dir /home/omero/workspace/OMERO-guides-push/.git # timeout=10
 > git config remote.origin.url https://github.com/ome/omero-guides.git # timeout=10
Fetching upstream changes from https://github.com/ome/omero-guides.git
 > git --version # timeout=10
 > git --version # 'git version 2.39.3'
 > git fetch --tags --force --progress -- https://github.com/ome/omero-guides.git +refs/heads/*:refs/remotes/origin/* # timeout=10
 > git rev-parse refs/remotes/origin/master^{commit} # timeout=10
 > git config core.sparsecheckout # timeout=10
 > git checkout -f 06eaa16a203dcfe3e22546549d40185a79f25ac7 # timeout=10
Commit message: "Merge pull request #290 from ome/dependabot/submodules/qupath-6db8b1c"
 > git rev-list --no-walk 06eaa16a203dcfe3e22546549d40185a79f25ac7 # timeout=10
Cleaning workspace
 > git rev-parse --verify HEAD # timeout=10
Resetting working tree
 > git reset --hard # timeout=10
 > git clean -fdx # timeout=10
 > git submodule foreach --recursive git reset --hard # timeout=10
 > git submodule foreach --recursive git clean -fdx # timeout=10
 > git remote # timeout=10
 > git submodule init # timeout=10
 > git submodule sync # timeout=10
 > git config --get remote.origin.url # timeout=10
 > git submodule init # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get-regexp ^submodule\.(.+)\.url # timeout=10
 > git config --get submodule.cellprofiler.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.cellprofiler.path # timeout=10
 > git config --get submodule.matlab.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.matlab.path # timeout=10
 > git config --get submodule.qupath.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.qupath.path # timeout=10
 > git config --get submodule.fiji.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.fiji.path # timeout=10
 > git config --get submodule.orbit.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.orbit.path # timeout=10
 > git config --get submodule.r.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.r.path # timeout=10
 > git config --get submodule.figure.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.figure.path # timeout=10
 > git config --get submodule.trackmate.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.trackmate.path # timeout=10
 > git config --get submodule.python.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.python.path # timeout=10
 > git config --get submodule.parade.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.parade.path # timeout=10
 > git config --get submodule.fpbioimage.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.fpbioimage.path # timeout=10
 > git config --get submodule.iviewer.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.iviewer.path # timeout=10
 > git config --get submodule.upload.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.upload.path # timeout=10
 > git config --get submodule.ilastik.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.ilastik.path # timeout=10
 > git config --get submodule.introduction.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.introduction.path # timeout=10
 > git config --get submodule.download.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.download.path # timeout=10
 > git config --get submodule.java.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.java.path # timeout=10
 > git config --get submodule.scripts.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.scripts.path # timeout=10
 > git config --get submodule.mde.url # timeout=10
 > git config -f .gitmodules --get submodule.mde.path # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive cellprofiler # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive matlab # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive qupath # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive fiji # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive orbit # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive r # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive figure # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive trackmate # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive python # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive parade # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive fpbioimage # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive iviewer # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive upload # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive ilastik # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive introduction # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive download # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive java # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive scripts # timeout=10
 > git submodule update --init --recursive mde # timeout=10